| |
|
|
| Registros recuperados : 23 | |
| 2. |  | LASTE, K. C. D.; CORREIA, M. E. F.; FARIA, S. M. de. Fauna do solo para avaliação de um reflorestamento em Angra dos Reis, RJ. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. FERTBIO 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
|   |
| 4. | | LASTE, K. C. D.; GONÇALVES, F. S.; FARIA, S. M. de. Estirpes de rizóbios eficientes na fixação biológica de nitrogênio em simbiose com Desmodium CF. Triflorum. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ.
Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 6. | | LASTE, K. C. D.; CORREIA, M. E. F.; FARIA, S. M. de. Monitoramento da faumna do solo como indicador de avanços na restauração com leguminosas arbóreas na Mata Atlântica. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. FERTBIO 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 7. | | GONÇALVES, F. S.; LASTE, K. C. D.; FARIA, S. M. de. Obtenção de estirpes de rizóbio eficientes na fixação de nitrogênio para Tephrosia adunca. In: FERTBIO; REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSITIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO FRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 15 a 19 de setembro de 2008 , Londrina, PR. Desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: Trabalhos... Londrina, PR: CBCS; Embrapa Soja; IAPAR; UEL, 2008. 1 p. Parceria: UFRRJ.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 8. | | GONÇALVES, F. S.; LASTE, K. C. D.; FARIA, S. M. de. Obtenção de estirpes de rizóbio eficientes na fixação de nitrogênio para Tephrosia adunca. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ.
Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 14. | | GONÇALVES, F. S.; LASTE, K. C. D.; UCHOAS, E. S.; BORGES, W. LO.; FARIA, S. M. de. Especificidade hospedeira de estirpes de rizóbio dentro da família Leguminosae. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 17., 2007, Seropédica, RJ. Anais... Seropédica: Editora da UFRRJ, 2007. 2 p. 1 CD-ROM. Parcerias: UFRRJ.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 17. | | LASTE, K. C. D.; OLIVEIRA FILHO, O. G. de; GONÇALVES, F. S.; UCHÔAS, E. da S.; FARIA, S. M. de. Indicação de estirpes de rizóbio selecionadas em vasos de solo para Mimosa pigra, leguminosa florestal usada na recuperação de áreas de mineração. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 17., 2007, Seropédica, RJ. Anais... Seropédica: Editora da UFRRJ, 2007. 2 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 19. | | LASTE, K. C. D.; UCHÔAS, E. da S.; GONÇALVES, F. S.; OLIVEIRA FILHO, O. G. de; FARIA, S. M. de. Obtenção de estirpes de rizóbio eficientes na fixação biológica de nitrogênio para Desmodium leiocarpum (barba selvagem). In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRRJ, 17., 2007, Seropédica, RJ. Anais... Seropédica: Editora da UFRRJ, 2007. 2 p. 1 CD-ROM. Parcerias: UFRRJ.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| 20. | | LASTE, K. C. D.; UCHÔAS, E. da S.; GONÇALVES, F. S.; OLIVEIRA FILHO, O. G. de; FARIA, S. M. de. Obtenção de estirpes de rizóbio para espécies de Desmodium leiocarpum utilizadas na recuperação de áreas degradadas. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 7., 2007, Seropédica, RJ. Resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
| |
| Registros recuperados : 23 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
|
Data corrente: |
16/06/2016 |
|
Data da última atualização: |
09/05/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
PÉRTILLE, F.; BOSAGNA, C. G.; SILVA, V. H. da; BOSCHIERO, C.; NUNES, J. de R. da S.; LEDUR, M. C.; JENSEN, P.; COUTINHO, L. L. |
|
Afiliação: |
FÁBIO PÉRTILLE, ESALQ; CARLOS GUERRERO BOSAGNA, Linköping University; VINICIUS HENRIQUE DA SILVA, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; JOSÉ DE RIBAMAR DA SILVA NUNES, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; PER JENSEN, Linköping University; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
|
Título: |
High-throughput and cost-effective chicken genotyping using next-generation sequencing. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 6, n. 26929, 2016. |
|
DOI: |
10.1038/srep26929 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Chicken genotyping is becoming common practice in conventional animal breeding improvement. Despite the power of high-throughput methods for genotyping, their high cost limits large scale use in animal breeding and selection. In the present paper we optimized the CornellGBS, an efficient and costeffective genotyping by sequence approach developed in plants, for its application in chickens. Here we describe the successful genotyping of a large number of chickens (462) using CornellGBS approach. Genomic DNA was cleaved with the PstI enzyme, ligated to adapters with barcodes identifying individual animals, and then sequenced on Illumina platform. After filtering parameters were applied, 134,528 SNPs were identified in our experimental population of chickens. Of these SNPs, 67,096 had a minimum taxon call rate of 90% and were considered ?unique tags?. Interestingly, 20.7% of these unique tags have not been previously reported in the dbSNP. Moreover, 92.6% of these SNPs were concordant with a previous Whole Chicken-genome re-sequencing dataset used for validation purposes. The application of CornellGBS in chickens showed high performance to infer SNPs, particularly in exonic regions and microchromosomes. This approach represents a cost-effective (~US$50/sample) and powerful alternative to current genotyping methods, which has the potential to improve wholegenome selection (WGS), and genome-wide association studies (GWAS) in chicken production. |
|
Thesagro: |
Avicultura; Melhoramento genético animal; Produção animal. |
|
Thesaurus NAL: |
Animal breeding; Poultry production. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144504/1/final8219.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02269naa a2200277 a 4500
001 2047245
005 2018-05-09
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1038/srep26929$2DOI
100 1 $aPÉRTILLE, F.
245 $aHigh-throughput and cost-effective chicken genotyping using next-generation sequencing.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aChicken genotyping is becoming common practice in conventional animal breeding improvement. Despite the power of high-throughput methods for genotyping, their high cost limits large scale use in animal breeding and selection. In the present paper we optimized the CornellGBS, an efficient and costeffective genotyping by sequence approach developed in plants, for its application in chickens. Here we describe the successful genotyping of a large number of chickens (462) using CornellGBS approach. Genomic DNA was cleaved with the PstI enzyme, ligated to adapters with barcodes identifying individual animals, and then sequenced on Illumina platform. After filtering parameters were applied, 134,528 SNPs were identified in our experimental population of chickens. Of these SNPs, 67,096 had a minimum taxon call rate of 90% and were considered ?unique tags?. Interestingly, 20.7% of these unique tags have not been previously reported in the dbSNP. Moreover, 92.6% of these SNPs were concordant with a previous Whole Chicken-genome re-sequencing dataset used for validation purposes. The application of CornellGBS in chickens showed high performance to infer SNPs, particularly in exonic regions and microchromosomes. This approach represents a cost-effective (~US$50/sample) and powerful alternative to current genotyping methods, which has the potential to improve wholegenome selection (WGS), and genome-wide association studies (GWAS) in chicken production.
650 $aAnimal breeding
650 $aPoultry production
650 $aAvicultura
650 $aMelhoramento genético animal
650 $aProdução animal
700 1 $aBOSAGNA, C. G.
700 1 $aSILVA, V. H. da
700 1 $aBOSCHIERO, C.
700 1 $aNUNES, J. de R. da S.
700 1 $aLEDUR, M. C.
700 1 $aJENSEN, P.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
773 $tScientific Reports$gv. 6, n. 26929, 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
